1986. szeptember 15-én az Apple bemutatta az Apple IIgs számítógépet, amely az Apple II család utolsó jelentős új modellje lett. A gép különleges átmenetet képviselt az Apple korábbi, jól bevált Apple II számítógépei és az akkor egyre fontosabbá váló Macintosh között.

Az IIgs nevében a „GS” a Graphics and Sound, vagyis „grafika és hang” kifejezésre utalt. A gép egyik legfontosabb újdonsága éppen a fejlett grafikus és hangrendszer volt. A számítógép egy 16 bites Western Design Center 65C816 processzort használt, amely lényegesen nagyobb teljesítményt biztosított az Apple II korábbi, 8 bites processzorainál. A IIgs ugyanakkor megőrizte az Apple II sorozat jelentős szoftveres és hardveres kompatibilitását is.

A gép grafikai képességei az Apple II korábbi modelljeihez képest hatalmas előrelépést jelentettek. Akár 4096 színt is képes volt kezelni, bár a különböző grafikus üzemmódokban egyszerre megjeleníthető színek száma ennél korlátozottabb lehetett. A hangrendszer szintén kiemelkedő volt: a beépített Ensoniq hangchip nyolccsatornás digitális hang lejátszására volt képes, ami különösen a játékok és a zenei alkalmazások számára jelentett nagy előrelépést.

Az Apple IIgs egyik érdekessége, hogy miközben az Apple a Macintosh felé próbálta terelni a felhasználókat, a IIgs bizonyos szempontból technológiailag fejlettebb volt a korabeli Macintosh gépeknél. Ez különösen igaz volt a grafikus és hangzási képességeire. A IIgs ráadásul megőrizte az Apple II sorozat egyik legfontosabb tulajdonságát: a felhasználók és fejlesztők számára sokkal nyitottabb és közvetlenebb platformot biztosított.

A számítógéphez készült egy új operációs rendszer, az GS/OS, amely már fejlettebb grafikus felhasználói felületet biztosított. Az Apple ezzel egy olyan gépet hozott létre, amely egyszerre próbálta kiszolgálni az Apple II hagyományos felhasználóit és az újabb, grafikus felületű számítógépek iránt érdeklődő közönséget.

Az Apple IIgs azonban már egy olyan korszakban jelent meg, amikor az Apple stratégiai figyelme egyre inkább a Macintoshra irányult. Emiatt a IIgs jelentős technikai képességei ellenére sem vált az Apple jövőbeli fő platformjává. Az Apple II termékvonal végül fokozatosan háttérbe szorult, miközben a Macintosh család fejlődött tovább.

Az utolsó Apple IIgs számítógépet 1992 decemberében gyártották, ezzel pedig egy több mint egy évtizeden át meghatározó számítógépcsalád története is lezárult. Az Apple II 1977-es megjelenésétől az utolsó IIgs gyártásáig az Apple II sorozat jelentős szerepet játszott a személyi számítógépek elterjedésében.