A DOS és Windows rendszerekkel való kompatibilitás már az Amiga kezdeti éveiben is fontos szempont volt. Azok, akik nem csupán játékra használták Amigájukat, hanem például AmigaOS-t telepítettek, szinte biztosan találkoztak a fat95 nevű fájlrendszer-kezelővel (handler). Hosszú időn át ez volt az egyetlen megoldás a FAT32 és a hosszú fájlnevek kezelésére, hiszen a gyári AmigaOS 2.0 részét képező CrossDOS nem támogatta ezt a funkciót.