Néhány esetben előfordulhat, hogy a rendszer betöltő- és választó alkalmazást, melynek manapság és általában véve a GRUB 2 a neve, hogy, hogy nem, újra kell telepítened. Jellemző történet ez a dual-boot rendszereknél, például, ha a Windows rendszert újratelepítetted, és ennek következménye, hogy nem a telepített Linux GRUB alkalmazása van használatban, azt a Windows újratelepítése eltünteti, pontosabban használaton kívül helyezi.